这个时候，有人建议李建成占据长安，背叛李渊，也有人建议李建成单枪匹马的到仁智宫，向李渊请罪。…≦頂點說，..想了想，李建成选择了第二个方案，在走到离仁智宫六十里路的地方，李建成将随从部属全部留了下来，只带了十几个骑兵卫士前往仁智宫。
看见李渊愤怒的眼神，李建成知道解释是没有用了，跪在地上，拼命的磕头，一个、两个、三个……到后来李建成自己也磕懵了，不知道自己磕了多少个，而且李建成知道什么时候磕头都可以偷懒，就这个时候不能偷懒，拼劲全力的去磕，额头上鲜血横流，这似乎对李渊也没有起多大的作用。
当天晚上，李渊把李建成软禁在帷帐中，只供以粗茶淡饭充饥，保住性命而已，命人严密看守，又派司农卿（农林部长）宇文融急往庆州，召唤杨文干。
宇文融一到庆州，杨文干就反了（之前还没反）。李渊命令李世民去平叛，并且向李世民承诺回来后立他为皇太子。现在李建成不行了，李元吉很紧张，要是大哥这么废了，我的皇帝也就当不成了，不行，得帮大哥一把。
在李元吉的动员下，张婕妤等老婆们不断的对李渊李建成的好话，什么孝顺，什么仁厚，是陛下最优秀的儿子，太子以后当皇帝一定是位明君，身上有的优了一遍，身上没有的优也了一遍，总之不能杀了太子。宰相封德彝也帮着李建成话，三人成虎。渐渐的李渊气削了一大半。
李世民解决了杨文干，也杀死了宇文融。在班师的路上做着当太子的美梦。回到长安后，李渊压根就没提这码事。就跟什么都没发生过一样，李建成依旧当太子，李世民还是他的秦王，李渊只是找了几个背黑锅的人物处理了一下，东宫王珪、韦挺、天策府杜淹等人被流放。
以上就是史书上记载的杨文干事件的始末，似乎这一切都是李建成的错。无理取闹造反者，是李建成；不守承诺者，是李渊；受委屈者，是李世民。
然而仔细把这个事件捋一遍。会发现很多的漏洞。首先杨文干在庆州造反，李建成能得到什么好处，答案是什么好处都得不到，因为杨文干是李建成的人，即使李建成不参与这件事都会受到牵连，李建成不会傻到冒这么大的风险做一件对自己完全没有好处的事情。其次，在处理这件事情的时候。
李渊以兄弟不合的罪名将王珪、韦挺、杜淹等人流放。王珪和韦挺都是东宫李建成的人，因为李建成犯的事，他们替主子背过。也还的过去，但是杜淹却是李世民的人。
杜淹是杜如晦的叔叔，因为久久没有升官，打算投奔李建成。房玄龄知道杜淹足智多谋，狡猾奸诈，害怕杜淹在李建成那里对李世民不利。于是就把杜淹推荐给了李世民。李建成犯了谋反罪，为什么反而李世民的人受惩罚？答案只有一个。李世民和这个事件有着不可脱离的关系，这个事件远远没有史书上写的那么简单。
该有多大的关系。能让属下被流放，李世民也只得不言不吭呢？因为这一切都是他背后操纵的，李建成只是让尔朱焕、桥公山送铠甲给杨文干，并没有让杨文干造反，然而尔朱焕、桥公山被李世民所收买，反过来告了李建成的一个黑状。